| Termin | Gospodarz | Gość | Grupa | Wynik |
|---|---|---|---|---|
| 29.09.16 17:00 | FK Qäbälä | FSV Mainz 05 | Grupa C | 2:3 |
| 29.09.16 17:00 | FK Astana | Young Boys Bern | Grupa B | 0:0 |
| 29.09.16 19:00 | Slovan Liberec | PAOK Saloniki | Grupa J | 1:2 |
| 29.09.16 19:00 | Hapoel Beer Sheva | FC Southampton | Grupa K | 0:0 |
| 29.09.16 19:00 | AC Fiorentina | Qarabag | Grupa J | 5:1 |
| 29.09.16 19:00 | Ajax Amsterdam | Standard Liège | Grupa G | 1:0 |
| 29.09.16 19:00 | Sparta Praga | Inter Mediolan | Grupa K | 3:1 |
| 29.09.16 19:00 | FC Schalke 04 | FC Red Bull Salzburg | Grupa I | 3:1 |
| 29.09.16 19:00 | Celta Vigo | Panathinaikos Ateny | Grupa G | 2:0 |
| 29.09.16 19:00 | Szachtar Donieck | Sporting Braga | Grupa H | 2:0 |
| 29.09.16 19:00 | FK Krasnodar | OGC Nice | Grupa I | 5:2 |
| 29.09.16 19:00 | FC Zurych | Osmanlispor FK Ankara | Grupa L | 2:1 |
| 29.09.16 19:00 | KAA Gent | Konyaspor | Grupa H | 2:0 |
| 29.09.16 19:00 | Steaua Bukareszt | FC Villarreal | Grupa L | 1:1 |
| 29.09.16 21:05 | FK Austria Wiedeń | Viktoria Pilzno | Grupa E | 0:0 |
| 29.09.16 21:05 | KRC Genk | Sassuolo Calcio | Grupa F | 3:1 |
| 29.09.16 21:05 | AS St. Etienne | RSC Anderlecht | Grupa C | 1:1 |
| 29.09.16 21:05 | Zenit St. Petersburg | AZ Alkmaar | Grupa D | 5:0 |
| 29.09.16 21:05 | Olympiakos Pireus | APOEL Nikozja | Grupa B | 0:1 |
| 29.09.16 21:05 | Athletic Bilbao | SK Rapid Wien | Grupa F | 1:0 |
| 29.09.16 21:05 | AS Roma | Astra Giurgiu | Grupa E | 4:0 |
| 29.09.16 21:05 | Fenerbahce Istanbul | Feyenoord Rotterdam | Grupa A | 1:0 |
| 29.09.16 21:05 | Manchester United | FC Zorya Lugansk | Grupa A | 1:0 |
| 29.09.16 21:05 | Dundalk FC | Maccabi Tel Aviv | Grupa D | 1:0 |